Есть константа
Добавлять поле "заказ" в табличную часть документов.
Если в этой константе установить "В документы реализации", то в документе "счет" станет активна Команда
Заполнить-Отобрать заказы, заполнить по заказам

Использование документа "Счет" представляется мне не очень целесообразным. Заказчикам и производителям окон удобно, чтобы номер счета совпадал с номером расчета в технологической программе. При печати счета по заказу покупателя этой проблемы нет, но есть преимущества:
1. Понятно, что присать в назначение платежа в платежке исходящей (делает покупатель)
2. Для выбора заказа в платежке входящей не надо проваливаться в список заказов, можно набрать номер в поле сделка.

Остановились на том, что счет нужно добавить в РМД
Некоторые клиенты его просят, а клиент всегда прав:)
Сформировать механизм формирования счета по нескольким заказам.
Для счета разработать внешнюю печатную форму, которая будет отражать, по каким заказам сформирован счет.