Остаток- остаток по регистру накопления Товары организаций
Свободный остаток =Товары на складах-Товары в резерве на складах- Товары к выдаче со складов
остатки по регистрам накопления.
Пришлось разобраться, поскольку был вопрос "Почему свободный остаток больше чем остаток". Оказалось, был проведенный ордер по удаленной реализации, он двигал в минус "товары к выдаче" и поэтому свободного остатка было больше чем просто остатка.

Регистр "Товары организаций" может быть отключен.
Тогда, смотрим на "товары на складах"